Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHST12Q9NRB3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms