Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms