Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KIAA1549Q9HCM3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms