Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms