Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP1Q9C000 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP1Q9C000 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms