Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms