Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL3Q9BXA9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL3Q9BXA9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms