Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms