Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms