Protein–RNA interactions for Protein: Q96L73

NSD1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1Q96L73 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSD1Q96L73 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSD1Q96L73 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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