Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms