Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms