Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms