Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms