Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms