Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP4Q86YS3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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