Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms