Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms