Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBR1LQ6UX01 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms