Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms