Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms