Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VSD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms