Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNRD1Q16881 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms