Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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