Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms