Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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