Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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