Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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