Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBR1Q14596 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms