Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPSQ13938 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPSQ13938 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms