Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MTMR3Q13615 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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