Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDAP1Q13442 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms