Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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