Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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