Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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KCNMA1Q12791 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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KCNMA1Q12791 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMA1Q12791 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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