Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD3Q0VAK6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms