Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms