Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms