Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms