Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms