Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXK2Q01167 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXK2Q01167 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms