Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL7P80098 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL7P80098 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL7P80098 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL7P80098 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms