Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms