Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms