Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BACE1P56817 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BACE1P56817 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms