Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms