Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT4P50991 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT4P50991 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT4P50991 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms