Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPS1P31327 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPS1P31327 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPS1P31327 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms