Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD34P28906 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD34P28906 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD34P28906 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD34P28906 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms