Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms